百果园商业模式存在的问题主要有以下几点：竞争激烈、商品种类有限、线上线下一体化的难度等。

百果园所处的行业竞争激烈，同样提供生鲜水果的电商平台层出不穷。为了突出差异竞争，百果园可以提供更多独特的产品，例如进口水果、有机水果等，以满足消费者不同的需求。百果园还可以加强与供应商的合作，获取更好的价格和品质，进一步提高竞争力。

百果园商品种类有限。除了水果之外，百果园可以进一步扩大商品范围，添加更多的生鲜品类，如新鲜蔬菜、肉类、海鲜等。这样不仅能够满足消费者的多元化需求，还可以提升客单价和用户留存率。

另外，百果园需要面对线上线下一体化的难题。目前，百果园主要依靠线上渠道进行销售，但是线下门店的作用也不可忽视。因此，百果园可以加强线上线下的融合，例如通过线上预约、线下自提等方式，提升用户的购买体验和便捷性。

百果园还可以通过推出会员制度、优惠券等活动来提升用户粘性，增加用户的重复购买率。同时，对于优质用户，百果园可以推出定制化服务，提供个性化购物体验，增加用户忠诚度。

百果园需要加强与物流公司的合作，提高配送效率和准时率，以确保商品能够及时送达消费者手中。

百果园可以通过提供独特商品、扩大商品种类、加强线上线下一体化、推出会员制度和提升物流效率等措施，解决商业模式存在的问题，不断提升竞争力和用户体验，实现可持续发展。